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由Sanford Burnham Prebys助理教授Lukas Chavez博士領(lǐng)導(dǎo)的研究人員正在利用最新技術(shù)對室管膜瘤進行前所未有的研究，這是最致命的兒科腦腫瘤之一。通過可視化基因組在腫瘤細胞內(nèi)的組織和排列方式，他們能夠揭示腫瘤中的基因，這些基因可能是未來治療的靶點。結(jié)果發(fā)表在Nature Communications上。

“人類基因組由許多蛋白質(zhì)編碼基因和更多的非編碼部分組成，這些部分都被緊密包裝并卷繞起來以適應(yīng)細胞的微小細胞核，”查韋斯說。“我們正在使用尖端技術(shù)來研究基因組的包裝和卷曲方式，這為我們對基因調(diào)控機制提供了獨特的視角。這種方法有助于我們了解基因組形狀與癌癥之間的聯(lián)系。

腦和脊髓腫瘤，包括室管膜瘤，是14歲以下兒童最常見的惡性癌癥，也是美國兒童期疾病亡的主要原因。

“室管膜瘤有許多不同的遺傳和分子亞型，可以影響患者對治療的反應(yīng)，”查韋斯說。“目前的護理標準治療包括手術(shù)后放療，這承擔了長期，治療引起的神經(jīng)系統(tǒng)副作用以及繼發(fā)性癌癥的風險。迫切需要新的、有針對性的室管膜瘤治療選擇。如果成功，我們的研究將導(dǎo)致新的，有效的藥物來治療這些危險的癌癥。

研究人員專注于最常見和最具侵襲性的疾病形式，主要發(fā)生在幼兒身上。他們使用了一種稱為3D基因組圖譜的新興技術(shù)，該技術(shù)可視化了細胞核內(nèi)基因的組織方式。

“科學(xué)歷來以二維方式研究基因組，重點是基因如何以長線性序列排列，”查韋斯說。“但是基因組和其他任何東西一樣是一個3D物體，基因在空間中的排列方式對這些基因在體內(nèi)的表達方式產(chǎn)生了影響。

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